弯刺蔷薇缘何成为月季的抗寒育种亲本
弯刺蔷薇。
本报讯(记者李晨 通讯员陈旭)中国农业科学院蔬菜花卉研究所(以下简称蔬菜所)研究员杨树华团队首次成功构建了弯刺蔷薇的两套端粒到端粒(T2T)无缺口单倍型基因组,系统揭示了弯刺蔷薇的进化历史,以及冷响应基因RbDHN3-1的功能。近日,相关研究成果发表于《园艺学研究》。
弯刺蔷薇是蔷薇属重要的野生种质资源,自上世纪90年代起,原产于我国西北地区的弯刺蔷薇作为关键的抗寒育种亲本,被蔬菜所研究团队应用于月季抗寒育种,育成了“天山”系列现代月季品种。目前,尽管已有部分月季品种的高质量基因组完成了组装,但弯刺蔷薇的基因组信息仍未解析,制约了其优异抗寒基因发掘及调控机制研究。
研究人员综合利用多种测序技术,首次成功构建了弯刺蔷薇的两套T2T无缺口单倍型基因组,大小分别为417.13Mb和421.87Mb,并精确鉴定了7个着丝粒和14个端粒区域,两套单倍型分别预测到38039和37962个蛋白编码基因。基于该高质量基因组,研究团队系统揭示了弯刺蔷薇的进化历史,即经历了古三倍化(γ)及与月季物种分化前的全基因组加倍事件,并鉴定出1917个物种特有基因和206个扩张基因家族显著富集于“胁迫响应”等生物学通路。
研究人员重点解析了冷响应基因RbDHN3-1的功能,过表达该基因的月季悬浮细胞和烟草均表现出冰点降低和抗氧化酶活性提升,显著增强了抗寒能力。
该研究不仅丰富了蔷薇属植物基因组信息,更为加速抗寒月季分子育种提供了关键理论依据和基因资源。
相关论文信息:https://doi.org/10.1093/hr/uhag210