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他同时表示,目前Pinal仍处于概念验证阶段,更多精细化的蛋白质功能设计需求,如通过文本指定荧光蛋白的发光波段,仍是下一阶段的科研挑战。
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”论文共同通讯作者原发杰告诉记者,该研究尝试将自然语言功能描述直接作为蛋白质设计的输入,为功能蛋白质设计提供了新路径。
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在传统蛋白质设计中,研究人员通常需要从天然蛋白质出发,通过结构分析、关键位点调整及多轮实验筛选,持续优化目标功能,整个过程复杂且试错成本较高。
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香港科技大学(广州)助理教授卢泓远团队,西湖大学助理教授原发杰、研究员刘建明团队,以及中国科学院深圳先进技术研究院研究员司同团队合作,提出了蛋白质设计模型Pinal。
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蛋白质
但随着后续功能数据的持续积累,以及AI模型与高通量实验技术的进一步融合,这种“用说话的方式设计蛋白质”的模式未来有望在绿色制造、环境治理、生物医药等领域释放应用潜力。
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因此,它检验的不只是单个蛋白质能否工作,还包括人工设计的蛋白质能否融入复杂的多酶反应体系。
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序列
这相当于让模型先知道“发挥这个功能的蛋白质长什么样子”,再设计序列。
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效果
这一思路类似于先根据功能需求绘制设计蓝图,再进一步确定具体组成,从而降低模型学习的复杂度,并提高候选设计的可靠性。
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影响
”卢泓远表示,“AI设计出来的序列能否在实验中真正发挥作用,是这项研究的关键。
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