基因组
描述
“每一棵树、每一种草本植物、每一种作物,它们都拥有各不相同的基因组,基因组是一本生物学的‘说明书’,靠数亿年的进化书写而成。
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分类
计划
目前,地球生物基因组计划正在致力于测序地球上所有真核生物的基因组;
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而脊椎动物基因组计划也已在动物研究中取得了令人惊叹的成果。
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数据
该计划通过基因组数据评估物种的遗传多样性和灭绝风险,比传统野外监测更高效。
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基因组学提供的是一个确定性的底层基础设施,无论国际局势如何变化,一套完整开放、代表全植物界多样性的基因组数据,将是全人类共同的科学资产。
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目前植物基因组资源存在严重的维度偏差,即大部分植物基因组数据来自于北半球温带、亚热带地区,热带和南半球的植物多样性被严重忽视,而恰恰是这些地区拥有地球上最丰富的植物多样性。
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“自2000年拟南芥基因组发布以来,26年过去了,我们仍处于植物基因组数据的‘碎片化时代’。
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基因组
”中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员、植物星球计划主要负责人之一王丽说,以被子植物为例,尽管已解码了超过1000种植物的基因组,但仍有约94%的属以及约34.5万个种的基因密码的黑匣子尚未打开。
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其主要内容包括对缺乏参考基因组的目、科、属进行采样,利用进化和功能基因组学方法,结合人工智能技术,挖掘植物基因组的共同规则。
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如果把植物基因组研究局限在某个国家或者区域内部,就等于把一个完整的生命故事撕裂成为碎片。
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这一宏伟倡议旨在通过解码陆地植物的遗传密码,构建一幅完整的“植物生命之树”,系统解析陆地植物的基因组多样性,并在此基础上推动基础研究与应用创新的融合发展,以应对粮食安全、生物多样性保护等全球性挑战。
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美国爱荷华州立大学教授、美国国家科学院院士JonathanWendel说:“这是一个非凡的计划,它将帮助我们理解植物基因组的深层联系,我能参与其中深感荣幸。
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”Weigel强调,此前,仍然没有一个面向陆地植物基因组的国际协调一致的大规模系统计划。
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区域
例如,AI可以识别哪些基因组区域是进化中“锁定”的功能基石,哪些是“创新热点”,从而预测基因功能。
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效果
基因组学本身就是大数据时代的产物,每一个高质量参考基因组的成本虽然在降低,但仍然需要大量的资金、设备和专业人才,如果各个国家、各个实验室各自为战,重复测序那些容易测的物种,而真正的演化空白无人问津,那是对全球科研资源的巨大浪费。
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“不仅仅是为了填补数据空白,更因为这些基因组将彻底改变我们对植物进化的理解、引导濒危物种的保护、推动下一代作物育种,并解锁野生植物中的新型药物。
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