科学家将现代野猪起源中心从“岛屿”重新定位至“大陆”
本报讯（记者李思辉 通讯员杜小勇）崖州湾国家实验室、华中农业大学联合国内外多家科研机构，系统整合全球不同地理区域的野猪与家猪基因组资源，将现代野猪的起源中心从东南亚岛屿重新定位至亚洲热带大陆，并发现一个约500万至300万年前的古代种间基因渐渗事件，如同一次跨越数百万年的“基因馈赠”，深刻塑造了猪的体形、寒冷适应能力，甚至在数百万年后被人类育种反复利用。相关成果近日发表于《科学》。
论文共同通讯作者、中国工程院院士赵书红表示，现代野猪是世界上分布范围最广的大型陆生哺乳动物之一，其起源地一直是演化生物学的核心议题之一。
此前主流观点认为，现代野猪起源于东南亚岛屿，随后扩散至欧亚大陆。然而，这一观点并未充分考虑杂交和重组对系统发育关系的影响，现代野猪真正的地理起源有待重新检验。
团队通过对多个地区猪遗传资源的基因组解析，发现南亚及邻近地区的野猪构成所有其他现代野猪和家猪谱系的姐妹群体，是目前发现的最早分化的现代野猪谱系。南亚野猪还表现出更高的遗传多样性、更大的历史有效群体大小。研究据此提出，现代野猪起源于亚洲热带大陆，南亚及我国西南部喜马拉雅区系是其早期分化和扩散的真正中心。
团队进一步揭示，东南亚岛屿野猪曾与当地近缘的爪哇疣猪等物种发生种间杂交。这些来自近缘物种的古老遗传成分，更容易保留在基因组高重组率区域，在系统发育分析中呈现出异常古老的“假象”。在排除这些复杂基因交流的影响后，南亚野猪的“始祖”地位得以昭示。
研究发现，野猪祖先曾在南亚及邻近地区与一种现已灭绝的古老猪亚科动物发生基因交流，由此获得了一段长约4300万碱基的古老X染色体单倍型。研究估计，这次古老基因渐渗事件发生于约500万至300万年前。该单倍型与较大的成年体形密切相关，并伴随野猪从南亚向亚洲北部和欧洲扩散，为理解野猪如何突破热带环境限制、适应高纬度寒冷环境提供了重要的遗传学线索。
有意思的是，这一大段帮助野猪适应寒冷环境的古老遗传物质，在数百万年后又被人类育种所利用。研究发现，这一X染色体单倍型在中国、欧洲和南亚的大型家猪中均受到强烈选择，并在不同地区被人类独立选择，参与塑造了现代大型家猪品种。这项研究不仅为现代野猪起源问题作出了新解答，其锁定的基因片段也有望为选育高产肉量、强抗逆性的猪品种提供新的依据。
相关论文信息：https://doi.org/10.1126/science.adq7553