告别盲盒筛选！分子之心发布MMDesign，抗体发现迈入可编程生物工程时代

机器之心发布

今日，分子之心正式对外发布全新的 AI 生物药从头设计平台 ——MMDesign 。

基于该平台，分子之心在极低的实验验证通量下，成功在细胞因子、免疫检查点、病毒蛋白及多次跨膜受体（如 GPCR ）等十多个高价值靶点上，实现了高精度的实用级纳米抗体的从头设计与验证，靶点结合成功率超过 90%, 最佳亲和力达皮摩尔级别。

这一成果标志着 AI 蛋白质设计从概念验证走向产业化应用的关键转折。抗体等生物制剂的研发正在实质性地从耗时费力且低成功率的大规模随机筛选，跨入精准、高效的 “ 可编程分子工程 ” 时代。

论文标题：

Practical De Novo Nanobody Discovery with Tens of Experimental Candidates

论文链接：

https://zenodo.org/records/20526590

重塑抗体发现范式：

极低通量跑通干湿闭环，靶点命中率超 90%

传统的抗体发现高度依赖动物免疫或大规模文库筛选，往往需要对数百万乃至数十亿的候选分子进行盲盒式的实验验证，且对结合表位和分子成药性质的可控性极低。

分子之心彻底重塑了这一发现范式。

MMDesign 采用 " 生成 - 过滤 " 策略。用户只需输入目标蛋白和指定的表位残基， MMDesign 便会通过分子之心自研的蛋白质基础大模型和 结构预测模型 MMFold 协同优化，一次性 生成数万个候选分子，再经由结构可靠性、序列自然性、和基于物理的界面评估等多层智能评估体系，将庞大的候选池极限压缩至每个靶点仅数十个分子进入湿实验验证。

在针对细胞因子、免疫检查点、受体蛋白及多次跨膜蛋白等 12 个高价值治疗性靶点的系统性评测中， MMDesign 针对每个靶点仅输出 14 到 50 个进入湿实验验证的分子，即在 11 个靶点上成功确认特异性结合，靶点成功率超过 90% ，展现出极强的靶点普适性。

同时， MMDesign 稳定输出了大量亲和力达到纳摩尔（ nM ）甚至皮摩尔（ pM ）级别的高活性实用级纳米抗体。以 PD-L1 为例，该靶点下的候选分子命中率达 86.7% ，最优分子亲和力（ KD ）低至 7.2nM 。

主题：分子之心