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破解血液中的密码,李佳团队发掘肿瘤早筛利器


速读:基于血浆游离肿瘤DNA全基因组拷贝数变异,李佳团队建立了一套针对多条染色体异常样本的肿瘤风险分析流程,并结合肿瘤标志物检测,将恶性肿瘤的阳性预测值提升至80%以上,为孕期肿瘤的早期筛查提供了更为精准的技术支持。 ”李佳介绍道。 面对这一难题,粪便和血液检测成为结直肠癌筛查的新趋势。 一例肝癌孕妇全基因组拷贝数异常和多条染色体离群散点图。
破解血液中的密码,李佳团队发掘肿瘤早筛利器|螺旋新知

“科研不是为了发 表文章,而是为了找到科学 的真相。”

导师的这句批评,像一盆冷水,浇灭了李佳初入科研时的燥热之火,也让他静下心来思考科研的真正意义:医学科研不仅是结果的展示,更是一场通向解决现有困境的探索之旅。如今,在华大基因智惠医学研究院,李佳以多组学技术为工具,致力于孕期疾病、肿瘤和慢性疾病等复杂病症的早期预测与干预研究,为临床 难题寻找 新的解决方案。

孕期肿瘤有迹可循

近年来,孕期肿瘤逐渐成为各国孕产妇死亡的主要原因之一,发生率约为1/1000,乳腺癌、黑色素瘤、宫颈癌和霍奇金淋巴瘤是常见类型。

“孕期肿瘤的发病隐匿性高,尤其是在母体生理变化的影响下,传统检测手段往往难以捕捉到早期信号。”李佳及其团队在大量孕妇无创产前基因检测(NIPT)结果中发现,部分孕妇存在多条染色体离群的情况。进一步追踪后发现,这些异常结果中有相当一部分与孕期肿瘤密切相关。

该团队研究分析发现,NIPT是依赖于母体血浆中胎儿游离DNA对胎儿染色体异常进行评估。但当孕妇罹患肿瘤时,肿瘤细胞的DNA也会进入母体血液中,形成循环肿瘤DNA(ctDNA),从而导致NIPT结果显示全基因组拷贝数的显著异常。

一例正常孕妇全基因组拷贝数分布散点图

一例肝癌孕妇全基因组拷贝数异常和多条染色体离群散点图

注:浅绿色表示≤0拷贝数,代表纯合型缺失;深绿色表示1拷贝数,代表杂合型缺失;蓝色表示2拷贝数,为正常结果;深红色表示3拷贝数,代表染色体片段重复;浅红色表示>4 拷贝数,代表染色体片段高水平重复。

孕妇患有肿瘤会导致NIPT结果中表现出多条染色体离群,但反过来一定成立吗?其实不然,只有不到10%的多条染色体离群与肿瘤有关,多数由其他因素导致,如子宫肌瘤,母亲本身存在染色体异常等。

基于血浆游离肿瘤DNA全基因组拷贝数变异,李佳团队建立了一套针对多条染色体异常样本的肿瘤风险分析流程,并结合肿瘤标志物检测,将恶性肿瘤的阳性预测值提升至80%以上,为孕期肿瘤的早期筛查提供了更为精准的技术支持。

“过去临床上NIPT检测结果异常往往重新检测或者采用其他手段。而现在我们深入分析这些异常,将这种异常转化为早期健康预警信号,从而帮助孕妇获益,这正是科研的价值所在。”李佳介绍道。

从血液中追踪 肠癌 信号

肿瘤的形成和扩散常伴随许多微弱但关键的生物信号。识别这些信号并及时干预,是当前抗癌研究的核心。

以结直肠癌为例,其早期症状不明显,干预窗口期较长,如果在早期筛查和干预,可大幅提高患者的生存率。然而,现行的结肠镜检查虽为金标准,但由于侵入性、肠道准备复杂、麻醉等因素,导致高风险人群的依从性较低。

面对这一难题,粪便和血液检测成为结直肠癌筛查的新趋势。2024年,哈尔滨市启动了覆盖240万人的消化系统肿瘤及“四高”免费检测项目,依托华大基因的粪便DNA甲基化检测技术对结直肠癌和进展期腺瘤风险进行评估,初筛出高风险人群后再进一步安排结肠镜检查。李佳介绍道:“粪便DNA甲基化检测技术具有较高的灵敏度和准确性,无创、无须限制饮食的特点大幅提升了依从性。然而,我们也发现部分人对于粪便检测存在抗拒。”

正因如此,依托于上述哈尔滨民生项目,李佳团队正开展消化道肿瘤的多组学研究,旨在构建针对结直肠癌和胃癌的多组学筛查模型。除了循环游离DNA(cfDNA)甲基化之外,团队还将代谢组学、肿瘤蛋白标志物检测、small RNA测序、免疫组库测序和肠道粪便宏基因组测序等多项数据整合进筛查模型,力图构建出一个更全面的早期肿瘤预警系统。

“血液检测的优势在于便捷性,且更易被患者接受。”李佳指出,“在敏感性和特异性上,我们希望血液检测能够与粪便DNA甲基化检测相当,甚至在部分维度上有所超越,使血液检测成为结直肠癌筛查的全面补充,满足不同场景和人群的需求,让结直肠癌筛查变得更便捷和高效。”目前,该项目的样本收集已顺利进行,预计将在一年内完成模型的初步验证。

在科学中探寻真相

刚读博士时,李佳也曾为迟迟未出论文成果而焦虑,急切地希望能尽快取得实验结果。然而,导师的一句批评“科研不是为了发表文章,而是为了找到科学的真相”如同当头棒喝,也让他正式踏上“寻找真相之旅”。

如何寻找真相?

“深入未知。”

如何证明你发现的就是真相?

“要经得起临床的验证。”

在李佳看来,这正是科研的魅力,一个漫长的探索过程,一个从未知到已知的过程。“就像NIPT的发展,十几年前它还只是一个科研结果,经历了临床反复验证后,现已广泛纳入我国染色体异常产前筛查与诊断体系中,为千万孕妇的健康新生保驾护航。”

近期,通过应用多组学检测技术,李佳的团队发现了预测早产的新蛋白质标志物。他介绍道:“我们使用这些蛋白标记物开发的早产预测技术显示出比临床已有的临床指标(如纤维连接蛋白1和宫颈长度测量)更好的筛查性能,当前正在推进该技术的临床转化。”

李佳与团队希望通过自己的探索,将研究成果成功转化为临床应用,解决当下技术和知识尚未能解决的难题,为社会带来一点点进步。

“过去,我们或许更多是在追赶欧美发达国家的步伐,而今天,我们已经站在必须自行摸索新路的‘深水区’。”李佳认为,这既是时代的挑战,也是一种自我突破的机遇。每一个发现都带来新的可能,每一步进展都是向科学真相更进一步。他坚信,正是在这条不断探索的道路上,即便只是找到真相的一部分,依然能为生命科学的进步和人类健康带来希望与改变。

主题:肿瘤|孕期肿瘤|多条染色体离群