更全更精细，首个千万级免疫细胞图谱发布
更全更精细，首个千万级免疫细胞图谱发布
免疫细胞是人体免疫系统不可或缺的重要组成部分，在发育、器官形成、疾病发生发展等方面发挥着关键作用。然而，由于技术和成本的限制，长期以来科学家们虽然知道免疫细胞种类繁多，却难以看清每个细胞的具体特征和它们之间的调控关系。
北京时间1月9日，由中国科学家组成的研究团队，在《科学》杂志上发布首个了千万级高分辨率免疫细胞图谱。他们对428位中国自然人群队列中超过1000万个外周血免疫细胞进行了系统性多组学深度解析，绘制了高分辨率人群免疫多组学图谱（CIMA）。
该研究由华大生命科学研究院牵头建设的基因组多维解析技术全国重点实验室联合上海交通大学医学院附属瑞金医院、山西医科大学等多家机构合作完成。不仅展示了千万个细胞的身份信息，及其调控开关信息，还系统性地回答了“哪个开关在哪种细胞里控制哪个基因”的问题，为理解疾病机制提供了更精细的视角，是生命数字化研究新范式的重要实践。
看清免疫细胞有一张“高清导航图”
以往，国际上高质量的免疫细胞数据大多来自欧洲人群，而东亚人群的系统性多组学数据则相对缺乏，这使得基于欧洲数据得出的结论和机制能否直接应用于东亚，尤其是中国人群成为一个根本性问题。
建立属于中国人群的高精度、多组学免疫细胞图谱，对提升中国人群疾病健康理解，推进我国精准医疗事业具有重要意义。
“单细胞多组学测序的成本长期居高不下，开展更大规模的细胞测序并非易事。另外，传统的免疫学研究大多只停留在主要细胞类型层面，而对占比较低的稀有细胞的分类和构成知之甚少。”论文共同通讯作者、基因组多维解析技术全国重点实验室研究员刘传宇表示。2021年，研究团队自主开发出了高效单细胞多组学平台DNBelab C4，使单细胞测序成本得以显著降低，为系统分析千万个细胞的大规模研究提供了关键技术支撑和保障.
他们对428位自然人群的超过一千万个免疫细胞中的单细胞转录组、表观组数据，以及血浆脂质组、代谢组等多组学数据进行分析，描绘了首个千万级高分辨率的免疫细胞图谱（CIMA）。研究团队成功鉴定出73种免疫细胞亚型，包括那些在血液中占比不足千分之一的罕见细胞，这些细胞虽然数量稀少，却在特定免疫应答中发挥着关键作用。“CIMA就像一张免疫细胞‘高清导航图’，突破了以往视角的局限。”刘传宇表示。
研究团队还为每种细胞建立了详细的“身份证”，记录了它们的分布及基因表达特征，并且结合了志愿者的生理数据，探索了年龄和性别等因素与特定免疫细胞特征的关联。