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​MIT研究团队推开源AI模型Boltz-1,推动生物分子结构预测


速读:Boltz-1是首个完全开源的模型,能够在生物分子结构预测方面达到与谷歌DeepMind的AlphaFold3相同的先进水平。 蛋白质在几乎所有生物过程中都起着关键作用,而蛋白质的形状与其功能密切相关,因此了解蛋白质的结构对于设计新药或工程化具有特定功能的新蛋白质至关重要。
2024-12-17 16:19

麻省理工学院(MIT)科学家们最近发布了一款强大的开源人工智能模型,名为 Boltz-1。这一创新有望显著加速生物医学研究和药物开发。

Boltz-1是首个完全开源的模型,能够在生物分子结构预测方面达到与谷歌 DeepMind 的 AlphaFold3相同的先进水平。该模型的开发团队来自 MIT Jameel 机器学习健康诊所,主要由研究生杰里米・沃尔文德和加布里埃尔・科尔索领导,合作团队还包括 MIT 的研究员萨罗・帕萨罗以及电气工程与计算机科学教授瑞吉娜・巴兹利和汤米・亚卡拉。

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在12月5日的发布会上,沃尔文德和科尔索表示,他们的最终目标是促进全球合作,加速科学发现,并提供一个稳健的平台以推进生物分子建模。科尔索提到,“我们希望这能成为社区的起点”,并强调 “Boltz-1” 而非 “Boltz” 的命名意图在于鼓励社区的参与。

蛋白质在几乎所有生物过程中都起着关键作用,而蛋白质的形状与其功能密切相关,因此了解蛋白质的结构对于设计新药或工程化具有特定功能的新蛋白质至关重要。由于蛋白质长链氨基酸折叠成三维结构的过程极其复杂,准确预测其结构一直是科学界面临的重大挑战。

DeepMind 的 AlphaFold2通过机器学习快速预测3D 蛋白质结构,精确度高得让实验科学家难以分辨。AlphaFold3则在此基础上进行改进,采用了生成式 AI 模型,但由于它并非完全开源,受到科学界的批评。因此,MIT 的研究团队着手开发 Boltz-1,遵循 AlphaFold3的基本思路,并在此基础上进行改进,提升模型的准确性和预测效率。

研究团队耗时四个月,进行了多次实验,克服了在蛋白质数据银行中遇到的模糊性和异质性问题。最终,他们的实验表明 Boltz-1在复杂生物分子结构预测方面达到了与 AlphaFold3相同的精度。

研究人员计划继续提升 Boltz-1的性能,并缩短预测时间。他们还邀请研究者在 GitHub 上试用 Boltz-1,并通过 Slack 频道与其他用户交流。研究团队希望 Boltz-1能够促进更广泛的合作,激发社区的创造性应用。

项目:https://jclinic.mit.edu/democratizing-science-boltz-1/

划重点:

🌍 Boltz-1是首个完全开源的生物分子结构预测模型,达到与 AlphaFold3相同的性能。

🧬 该模型的开发旨在促进全球合作,推动生物医学研究与药物开发。

🔬 MIT 团队希望通过 Boltz-1简化蛋白质结构预测,使更多科研人员能够使用这一强大工具。

主题:Boltz-1|蛋白质|Boltz-1是首个完全开源